Porasty lužných lesov sú významné pre lesných hniezdičov avifauny špecificky viazanej na toto prostredie. Územie Dunajských luhov je aj významným územím pre hniezdenie vodného vtáctva. Rozsiahla vodná plocha Hrušovskej zdrže je významným biotopom pre hniezdenie 3 druhov čajok a rybára riečneho. Biotop Dunajských lužných lesov, najmä nerušené staré pôvodné zachovalé porasty na hniezdenie a výskyt si vyberajú orliaky morské. Práve odľahlé a človekom málo navštevované ťažko dostupné porasty s dostatkom starých stromov sú ideálnym miestom pre stavbu ich veľkého hniezda. Ako loviská orliaky morské v povodí Dunaja využívajú sústavu mŕtvych ramien i samotný Dunaj, Hrušovskú zdrž - jej rozsiahlu plochu, ale aj priľahlé agrocenózy. Vodná plocha zdrže Hrušov je významným zimoviskom pre viaceré druhy vodného vtáctva, ktoré sú zhromaždené v početných kŕdľoch, práve medzi zimujúcim vtáctvom na hladine vodných plôch a orliakmi vyhľadávajúcimi dostupnú potravu je priama súvislosť. Ďalšími významnými hniezdičmi dunajských lužných lesov, ktoré majú na hniezdenie a na hniezdny výskyt podobné nároky ako orliak morský, sú haja tmavá a bocian čierny. Práve tieto tri druhy v súčasnosti na Podunajsku závažne ohrozuje, narúša a negatívne vplýva na samotný priebeh hniezdenia necitlivé lesné hospodárenie, nelegálne výruby, pytliactvo, poľovanie a intenzívny rybolov. Dunaj je najvýz-namnejším zimoviskom vodného vtáctva a významným migračným koridorom. Práve v mimo-hniezdnom období - jarný a jesenný ťah umožňuje ornitológom pozorovať aj početne zastúpené kŕdle vodného vtáctva (bahniaky, čajky, rybáre a zúbkozobce - kŕdle zúbkozobcov (najmä kačice ako napr. chochlačka sivá a vrkočatá), ktoré sa zvyknú začínať koncentrovať už koncom letného obdobia.
Celkovo oblasť dunajských luhov je na hniezdenie, zimovanie a ťah vtáctva unikátnym súborom biotopov, ktoré majú v medzinárodnom meradle veľký význam.
